Le syndrome de l’intestin irritable (SII) touche plus de 5% de la population générale, et est défini par la présence de douleurs abdominales chroniques et de troubles du transit en l’absence d’anomalie organique. Des altérations du microbiote intestinal ont été décrites, et semblent jouer un rôle dans la physiopathologie de la maladie, notamment dans les SII post-infectieux.